Doutoramento em Ciência e Engenharia de Materiais (FCT/UNL, 2018); Mestrado em Conservação e Restauro (FCT/UNL, 2007); Licenciatura em Engenharia Metalúrgica e de Materiais (IST/UTL, 1987).
Rui Borges doutorou-se nas ligas de prata portuguesa dos séculos XV a XVII. Os seus interesses focam-se principalmente no conhecimento dos metais antigos: Investigação e caracterização de materiais patrimoniais e culturais; Estudos de arqueometalurgia; Investigação das tecnologias de produção e sua relação com fontes antigas de matérias-primas; Estudos de proveniência e identificação de centros de produção antigos; e Diagnóstico e conservação de objetos metálicos.
Os trabalhos mais recentes contribuem para o estudo das ligas de prata monetária portuguesas da era das Descobertas.
Caracterização microestrutural e elementar de metais que constituem objectos patrimoniais antigos; Arqueometalurgia; Estudos de proveniência de ligas de pratas e ligas de cobre.
Caracterização microestrutural e elementar de metais que constituem objectos patrimoniais antigos; Arqueometalurgia; Estudos de proveniência de ligas de pratas e ligas de cobre.